电影《罪孽的代价》带领观众进入了中世纪的英格兰，一个特别寒冷的冬天。故事聚焦于一名被教会追杀的牧师尼古拉斯（由保罗·贝特尼饰演），他因与一名女教徒相恋而被迫流亡。为了躲避教会的惩罚，尼古拉斯躲入了一个流浪剧团。

这个流浪剧团在偶然间来到了一个小镇，发现一个女性被指控谋杀罪，因涉及巫术而面临死刑。镇上的法官已经宣判了她的死刑。然而，剧团的领袖马丁（由威廉·达福饰演）是一位具有天赋异能的人，他和尼古拉斯都相信这名女性是无辜的。为了洗刷她的清白，马丁决定将这宗谋杀案改编成一出舞台剧。

在舞台上，他们成功地演绎了整个案件，引起了观众的共鸣和同情。这个女人最终幸免于死。这个事件的成功不仅救了一条生命，也使这个流浪剧团的舞台成为信徒们申冤昭雪的圣地。

然而，随着时间的推移，尼古拉斯过去的罪行渐渐浮出水面。他决定不再逃避，而是要承担起自己的罪孽，寻求弥补。这部电影深刻地探讨了正义、罪恶和道德的复杂性，同时也呈现了人性中的善与恶的冲突。